Секвенатор второго поколения запущен в НИИ Комплексных проблем Адыгейского государственного университета

На приобретение нового оборудования по распоряжению председателя Правительства РФ Михаила Мишустина была выделена субсидия в размере 41 млн рублей.

Комплект оборудования представляет собой систему секвенирования на основе полупроводникового метода, позволяющую проводить современные геномные исследования, используя простые протоколы таргетного секвенирования.

Секвенатор второго поколения Ion GeneStudio S5 позволяет быстро определять нуклеотидную последовательность в образцах ДНК или РНК, что открывает будущее для персонализированной медицины. Капиллярный секвенатор используют как золотой стандарт для подтверждения обнаружения различных мутаций, генотипирования, идентификации коротких тандемных повторов и профилирования экспрессии генов.

Новое оборудование поможет повысить эффективность научно-исследовательской работы ученых иммуногенетической лаборатории НИИ Комплексных проблем Адыгейского государственного университета, которые проводят исследования пусковых механизмов развития социально-значимых заболеваний: ранние репродуктивные потери, атеросклероз, бронхиальная астма, онкологические заболевания женской репродуктивной системы. Материалы для научных исследований предоставляются Республиканской клинической больницей с информированного согласия пациентов.

– Исследуя образцы ДНК на секвенаторе, мы можем определить, какой участок ДНК является поврежденным. Секвенатор дает возможность расшифровать последовательность ДНК 40 необходимых областей метилирования генов и сравнить картину у заболевших и здоровых людей. У больных онкологическими заболеваниями те или иные гены молчат, либо наоборот «экспрессируются», то есть работают на более высоких уровнях, чем у здоровых людей. И мы будем сравнивать уровень экспрессии этих генов у больных и здоровых, чтобы определить, какие гены отвечают за развитие онкологических заболеваний, – рассказала заведующая лабораторией, профессор АГУ Аминат Тугуз.

Высокоспециализированное оборудование – залог успешного научного эксперимента. Помощь в подготовке к запуску нового оборудования ученым АГУ оказали специалисты компания «ИнтерЛабСервис» г. Москвы.

– Секвенатор второго поколения Ion GeneStudio S5 обладает гибкостью и может проводить как небольшие исследования, так и исследования, требующие высокой производительности. Технология полупроводникового секвенирования, используемая в приборах Ion GeneStudio S5, сокращает время запуска до нескольких часов, а время полного анализа - до 24 часов, а также и позволяет использовать для анализа всего 1 нанограмм ДНК или РНК и анализировать до 15 Гб данных в день, – отметила менеджер компании «ИнтерЛабСервис» Жанна Альхова.